聚丙烯酰胺凝膠具有突出的優勢
聚丙烯酰胺凝膠由于其突出的優點，在過去的40年中得到了廣泛的應用，沒有更好的支撐介質替代它。它的主要優點是：
1可隨意控制凝膠濃度“T”和交聯度“C”，得到不同的有效孔徑，可用于分離不同分子量的生物分子。
(2)同樣的方法可以將分子篩和電荷效應結合起來，靈敏度可達到10≤9~10≤12 mol/L。
(3)由于聚丙烯酰胺凝膠是由C≥C鍵結合的酰胺類聚合物，側鏈僅含有活性氨基-CO-NH2，不含其他電荷基團，化學惰性好，電泳過程中不存在“電滲透”現象。
(4)由于可以制備純度較高的單體原料，因此電泳分離具有較好的重現性。
5透明度好，易于拍照和復印。機械強度好，彈性好，不易斷裂，操作方便，節省。
6無紫外吸收，不染色可用于紫外波長凝膠掃描的定量分析。
7還可作為酶固定化的惰性載體。
